Il Museo è stato fondato con atto notarile nel mese di marzo dell'anno 1980 da un gruppo persone che in comune avevano la passione della ricerca paleontologica naturalistica e storica con particolare riferimento alla zona carsica e al periodo compreso tra il 1915 e il 1918. Scopo principale della sezione geologico - paleontologica è lo studio della paleontologia regionale, specialmente la zona carsica, la raccolta guidata di reperti fossili, la loro catalogazione e conservazione e non ultimo la divulgazione pubblica degli studi e dei risultati ottenuti. Il materiale già a disposizione dei soci fondatori è stato esposto al pubblico, una prima volta, in maniera provvisoria, a Turriaco in una sede messa a disposizione dall’Amministrazione Comunale.
Successivamente l'esposizione è stata trasferita a Monfalcone presso la Chiesetta di S. Nicolò nelle immediate vicinanze della attuale Chiesa parrocchiale. L'esposizione permanente venne più volte aggiornata fino a raggiungere,nel 1986, la nuova inaugurazione che ha visto un completo rinnovamento delle strutture e dei criteri espositivi che vennero allora considerati all'avanguardia soprattutto in considerazione degli aspetti didattico- culturali che la mostra presentava ed il servizio rivolto in prevalenza alle scolaresche di ogni ordine e grado. Il museo ottenne l’anno seguente la denominazione di Museo Minore e venne inserito nell’elenco ufficiale dei musei minori regionali e nella rispettiva guida. Tale esposizione continuò sino al 1990, anno in cui la Chiesa venne ristrutturata e riaperta al culto. Da allora i materiali sono immagazzinati e attendono una nuova e più adeguata collocazione.
Attualmente la raccolta Paleontologica in nostra gestione e custodia rappresenta un esempio quasi unico nel suo genere per completezza e qualità dei reperti ed è sicuramente un validissimo strumento didattico a disposizione della cittadinanza, delle scolaresche e di esperti studiosi che su richiesta possono visionarla.